وينعقد المجلِس بدعوة من رئيسه، ويكون انعِقادُه صحيحاً بحضور أغلبية أعضائِه. وتصدُر القرارات بأغلبية أصوات الحاضرين، وعند تساوي الأصوات يُرجح الجانِب الذي فيه الرئيس. ويجوز أنَّ ينعقد المجلِس في الأحوال الاستثنائية وبناءً على طلب أربعة من أعضائِه، ويكون للمجلِس أمين مِن بين موظفي المؤسسة يختارُه رئيس مجلِس إدارة المؤسسة يتولى سكرتارية المجلِس والإعداد للاجتِماعات وتسجيل مُداولات المجلِس وقراراتِه وإبلاغِها للجهات المعنية.

المادة الرابعة:

مجلِس الإدارة هو السُلطة العُليا المُهيمِنة على شؤون المؤسسة وتصريف أمورِها، ولهُ أن يتخذ كافة القرارات اللازِمة لتحقيق أغراضِها وأهدافِها، وذلك كُلِه في حدود أحكام هذا النِظام. وللمجلِس على وجه الخصوص:

1- وضع مشروع بالسياسة العامة التي يسير عليها في تشغيل وإنشاء الموانئ وتطويرِها، ويتم بعد إقرارِه من مجلِس الوزراء العمل بموجبِه.

2- إصدار القرارات واللوائح الداخلية، والقرارات المُتعلِقة بالشؤون الإدارية والفنية للموانئ.

3- إصدار اللوائح المُنظِمة لشؤون الموظفين السعوديين وغيرِهم، بالاتِفاق مع ديوان الموظفين.

4- إصدار اللوائح المالية للمؤسسة، بالاتِفاق مع وزارة المالية والاقتِصاد الوطني.

5- إعداد مشروع الميزانية السنوية، وحسابِها الختامي.

6- تعيين الموظفين والاستشاريين والخُبراء بالمؤسسة، سعوديين ومُتعاقدين.

7- إبرام الاتِفاقيات والعقود بأنواعِها، مع الأفراد والمؤسسات والشركات والمُنظمات - سعودية أو أجنبية محلية أو دولية - فيما لهُ علاقة بأغراض ونشاطات الموانئ التابِعة للمؤسسة.

8- لمجلِس الإدارة حق تفويض بعض صلاحياتِه وسُلُّطاتِه لرئيس مجلِس الإدارة، ويجوز لمجلِس الإدارة أنَّ يُشكِّل من بين أعضائه لِجاناً تتولى دِراسة الموضوعات التي يُحيلها إليه المجلِس، وتقديم دراساتِها إليه للبت فيها. ويجوز عند الاقتِضاء - وبموافقة المجلِس - أنَّ تضُم هذه اللِّجان أعضاء فنيين من غير أعضاء المجلِس.

المادة الخامسة:

تتكون أموال المؤسسة مِن:

1- عائدات الموانئ.

2- الأموال التي تُساهِم بِها الخزانة العامة للدولة.

3- الأموال الثابِتة والمنقولة الواقِعة تحت تصرُّف الموانئ، وكذلك كافة الأموال المُستخدمة حالياً في إدارة الموانئ، وحقوقِه والتِزاماتِه في مواجهة الغير.

المادة السادسة:

يُصدِر رئيس مجلِس الوزراء بناءً على اقتِراح مجلِس إدارة المؤسسة، قراراً بتحديد صلاحيات رئيس مجلِس إدارة المؤسسة، والمُدير العام، ومُديري الموانئ.

المادة السابعة:

يُساعِد مُدير عام المؤسسة رئيس مجلِس إدارة المؤسسة للقيام بأعمالِه، كما يحل محلُه في حالة غيابِه.

المادة الثامنة:

يُدير كُل ميناء مُدير يرتبِط مُباشرة برئيس مجلِس الإدارة، ويُعطى كافة الصلاحيات اللازِمة لإدارة الميناء. ويُشكَّل في كُل ميناء مجلِس استشاري، يتألف مِن مُّمثِلين عن الإدارات الحُكومية العامِلة في الميناء مع مُّمثِل عن كُلٍ مِن: الغُرف التِجارية، ووكلاء الشحن البحريِّ. وتكون مهمة المجلِس تقديم المشورة إلى إدارة الميناء لتحسين أعمالِها، وحل المشاكِل التي تعترض أعمالِه اليومية.

المادة التاسعة:

تُنقل إلى المؤسسة بمُجرد صدور المرسوم الملكي جميع الحقوق والالتِزامات المُترتِبة على نشاط إدارة الموانئ.

المادة العاشرة:

تكون للمؤسسة ميزانية مُستقِلة، تُراعى فيها القواعِد المُتبعة في إعداد الميزانية العامة للدولة، وتبدأ سنتُها مع السنة المالية للدولة. ويجوز للمؤسسة أن تضع ميزانية للمشاريع والتي تزيد مُدتِها عن سنة.

المادة الحادية عشرة:

تتمتع المؤسسة بالإعفاءات والمزايا الأُخرى التي تتمتع بِها الجهات الحُكومية من النواحي المالية والضريبية.