دونت الدواوين وانشئ البريد البوسطة لنقل المراسلات بكل سرعة ووضع التاريخ الهجري وفي 24 ذي الحجة سنة 23 طعنه ابو لؤلؤة بسكين وقت الصلاة وتوفي رحمه الله في يوم السبت آخر ذي الحجة سنة 23 فكانت مدة خلافته عشر سنين هجرية وستة أشهر وثمانية ايام ودفن في الحجرة الشريفة النبوية
وبويع بعده عثمان بن عفان رضي الله عنه واشهر ما حدث في خلافته فتح افريقيا ويعني بها تونس والجزائر ومراكش وغزو بلاد الاندلس وجزيرة قبرص ونسخ القرآن الذي جمع في خلافة ابي بكر وكان مودوعا عند السيدة حفصة زوجة النبي صلى الله عليه وسلم وارسال نسخ منه إلى جميع البلاد وحرق ما سواه من النسخ وبذلك حفظ القرآن من التغيير والتبديل إلى يومنا هذا وسيبقى كذلك إلى آخر الدهر ثم عزل عثمان اغلب الولاة وعين بدلهم اقاربه فولى الكوفة الوليد بن عقبة وكان اخاه من امه وعزل عمرو بن العاص عن مصر وولاها عبد الله بن ابي السرح العامري وكان اخا عثمان من الرضاعة وعزل ابا موسى الاشعري عن البصرة وولاها ابن خاله عبد الله بن عامر فنقم عليه كثير من الناس واتت المدينة وفود من مصر والكوفة والعراق وبعد مسائل يطول شرحها في هذه المقدمة حصلت فتنة كانت نتيجتها قتل عثمان في داره ليلة 18 ذي الحجة سنة 35 فكانت مدة خلافته اثنتي عشرة سنة هجرية الا اياما قلائل ودفن مع النبي صلى الله عليه وسلم وعمر رضي الله عنه وبعد موته حصلت البيعة لسيدنا علي بن ابي طالب كرم الله وجهه وابتدأ