في أيلول 1946 (1)، ومارس الحزب نشاطاً معارضاً سرياً طوال مراحل عمله (2).

وقد وقف الحزب موقفاً معارضاً من الانتخابات التي أجرتها وزارة نوري السعيد عام 1947، وبدأت الحكومة بالضغط على أعضائه القياديين (3)، لاسيما بعد ان أسهم الحزب مع باقي الأحزاب السياسية في مقاومة "معاهدة بورتسموث" واشترك في لجنة التعاون الوطني اليسارية التي تشكلت في أواخر عام 1947 ومثل الحزب فيها رشيد عبد القادر عضو اللجنة المركزية الأولى للحزب، وتمكن الحزب من عقد مؤتمره الثاني في آذار 1951 في بغداد وتم انتخاب لجنة مركزية جديدة (4)، أصبح فيها إبراهيم أحمد سكرتيراً للحزب (5).

ويعد حزب البعث العربي الاشتراكي ثالث هذه الأحزاب السرية أيضاً، وقد تأسس بصفة رسمية خلال ربيع عام 1947 في دمشق بعد ان أقر نظامه الداخلي إثر اجتماع المؤتمر العام لأعضاء الحزب الذي دام ثلاثة أيام من 4 - 7 نيسان 1947 وانتخب ميشيل عفلق رئيساً له (6).

وفي العام نفسه بدأت تأثيرات حزب البعث في العراق من خلال الطلاب والمعلمين السوريين الذين كانوا يدِّرسون في العراق، ومنهم المدرس السوري أدهم مصطفى الذي استطاع تشكيل أول خلية لحزب البعث في العراق (7). ثم تطورت وتحولت عام 1949 الى فرقة لتتحول الفرقة بعد توسع التنظيم فأصبحت شعبة تضم ثلاث فرق هي الكرادة والأعظمية والكرخ، وضمت كلاً من شمس الدين كاظم وفخري قدوري وسعدون حمادي وفايز إسماعيل وتحسين معله وجعفر قاسم حمودي وفؤاد الركابي وطه الرشيد وغيرهم (8). وفي عام 1952 أصبح تنظيم الحزب فرعاً وقد أعترفت بهذا التنظيم القيادة القطرية في سورية (9).