صادف المسلمون في كثير منها مقاومة شديدة، وتكبدوا فيها خسائر فادحة بالأرواح، وجري فتح بعض المناطق والمدن عنوة.
وكان لتلك المقاومة أسباب كثيرة، لعل أهمها: مناعة البلاد الطبيعية كوعورة الجبال وسعة الصحاري وتعدد الأنهار، ومناعة المدن الإصطناعية، كالقلاع والحصون والأسوار.
كما أن من الأسباب، تفوق المقاومين من أهل البلاد على الفاتحين عددا وعددة، فقد كان قسم من حکام تلك المناطق يحتفظون بجيش قوي، يدافعون به عن بلادهم حين يكون الأكاسرة أقوياء، ويقاومون جيش کسري حين تضعف السلطة المركزية، فهم غالبا مع کسري القوي وعلى كسرى الضعيف.
فلما انهارت السلطة المركزية بعد معركة (نهاوند) الحاسمة، بقيت مقاومات السلطات المحلية، التي تتناسب تناسب طرديا مع قوة جيوش تلك السلطات ومناعة مناطقها الطبيعية والإصطناعية.